P3 R热图绘制01

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数据分析编程语言R语言数据可视化矩阵运算包安装ggplot2heatmap主成分分析生存分析数据框数据转换
本视频重点介绍了如何在R语言环境下使用数据可视化包,如GGplot2、heatmap等,来绘制多种图形,包括热图、散点图和泡泡图等。演示如何从生成或导入数据开始,对数据进行格式化,并依据数值矩阵展示不同水平的基因表达,展示样品间的相关性。重点讲解了数值矩阽数学运算及其转换为长格式数据框的方法,这对于使用GGplot2等可视化工具非常重要。演示了使用melt函数进行数据转换和使用GGplot2构建热图的基础步骤,突出了矩阵操作和数据可视化技能对数据分析的重要性。
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陈同 生信宝典
2009 年本科毕业于东北林业大学,2015 年硕博毕业于中国科学院遗传与发育生物学研究所,研究方向涉及高通量数据分析、生物信息工具开发、合成生物学、表观组学等,在Cell Stem Cell (封面文章),Nucleic Acids Research,Nature communications, Protein & Cell, iMeta等高水平杂志以第一或通讯作者发表文章十余篇,累积引用 3000 +次;开发在线绘图和分析平台 ImageGP、BIC、EVenn、植物整合基因组平台IMP (获中华中医药学会 2023 年年度十大学术进展之一),使用超 70 万人次;运营有十四万人关注的微信公众号《生信宝典》,分享有1400 多篇生物信息分析原创文章、教程和视频,阅读播放千万次。联合创办iMeta期刊,现为执行主编,致力于打造微生物和生物信息领域的国产高水平综合性杂志。
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