P16 R绘制韦恩图、UpSetView 02

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数据分析编程语言R语言数据可视化upsetr包集合分析交并集矩阵数据交集展示样品分析柱状图颜色编码
在数据分析领域,如何清晰展示集合间的交并情况成为一个常遇到的难题,尤其是当面对多个集合时。视频中介绍了使用R语言的upsetR包来处理并可视化集合数据的技术。提到的数据输入格式为矩阵,其中1和0分别表示集合中元素的存在与否。使用upset函数,我们可以基于输入数据绘制出upset view,这种视图能以直观的方式展现不同集合间的交集和独特元素。视频还演示了如何通过调整参数,比如交集显示选项(empty the intersection)和颜色编码来改善视图的清晰度,使得结果更加易于理解。这些技术对数据分析师、生物信息学家、科研人员等对复杂数据集进行深入分析的专业人士十分有用。
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陈同 生信宝典
2009 年本科毕业于东北林业大学,2015 年硕博毕业于中国科学院遗传与发育生物学研究所,研究方向涉及高通量数据分析、生物信息工具开发、合成生物学、表观组学等,在Cell Stem Cell (封面文章),Nucleic Acids Research,Nature communications, Protein & Cell, iMeta等高水平杂志以第一或通讯作者发表文章十余篇,累积引用 3000 +次;开发在线绘图和分析平台 ImageGP、BIC、EVenn、植物整合基因组平台IMP (获中华中医药学会 2023 年年度十大学术进展之一),使用超 70 万人次;运营有十四万人关注的微信公众号《生信宝典》,分享有1400 多篇生物信息分析原创文章、教程和视频,阅读播放千万次。联合创办iMeta期刊,现为执行主编,致力于打造微生物和生物信息领域的国产高水平综合性杂志。
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