P7 IMP - Gene fishing module

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基因表达分析功能基因识别相关性网络可视化属性定制在线数据浏览数据下载高通量数据处理用户界面交互相关性计算演示输入
为了识别具有相似表达模式的附加基因,这些基因可能功能相似或共享功能,研究人员可以使用基因渔捞模块来计算所选基因与整个基因池之间的斯皮尔曼相关性值。这种方法揭示了显著相关的基因,并生成信息丰富的相关性网络图,助于研究者理解基因间的潜在关系。此过程中,用户可以自定义可视化属性以生成合适的相关性网络,以蓝点表示输入基因,红点表示与输入基皮尔曼相关系数较高的基因。注意,网络图中最多只能显示五百个边,而完整结果可以在线浏览或下载。视频教学还介绍了如何通过用户界面交互,选择必要参数,并提供了操作指示和输入方法的占位信息,同时演示了如何使用演示输入功能。
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陈同 生信宝典
2009 年本科毕业于东北林业大学,2015 年硕博毕业于中国科学院遗传与发育生物学研究所,研究方向涉及高通量数据分析、生物信息工具开发、合成生物学、表观组学等,在Cell Stem Cell (封面文章),Nucleic Acids Research,Nature communications, Protein & Cell, iMeta等高水平杂志以第一或通讯作者发表文章十余篇,累积引用 3000 +次;开发在线绘图和分析平台 ImageGP、BIC、EVenn、植物整合基因组平台IMP (获中华中医药学会 2023 年年度十大学术进展之一),使用超 70 万人次;运营有十四万人关注的微信公众号《生信宝典》,分享有1400 多篇生物信息分析原创文章、教程和视频,阅读播放千万次。联合创办iMeta期刊,现为执行主编,致力于打造微生物和生物信息领域的国产高水平综合性杂志。
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