公开笔记对他人可见,有机会被管理员评为“优质笔记”
{{ noteEditor.content.length }}/2000
P16 IMP - DE Gene analysis module
新工具可执行基因差异表达分析,辅以limma pipeline,以简化样本或群组的选择及对比,并进行功能富集分析。用户通过样本选择启动分析,系统识别潜在异常样本,结果在两个框内显示。样本关系通过热图和PCA图可视化展示,用户可进一步选择不同主成分以生成跳点图。随后进行群组比较,拖放样本群组进行对比分析。设置阈值步骤中,筛查差异基因并进行功能富集分析。结果页面展示所有分析参数,提供读数计数矩阵下载,并展示样本关联分析、差异表达基因结果,火山图和基因本体论术语的气泡图。适合分子生物学家、生物信息学家、数据分析师、遗传学研究者、生物统计学家。
P3 Gene details page
本视频概述了一种基因数据分析工具,展示了如何通过各种基因注释信息来促进科研人员的研究。工具包括基因位置、转录、描述、GO术语及KGG通路的快速导航,以及基因和蛋白表达数据的可视化。该工具还提供复制和下载基因编码序列的功能,便于后续实验设计。生物信息学研究者可通过该工具检索基因表达模式,并定制不同数据集参数以适应不同组织、器官或处理阶段的研究。同时也对蛋白功能域进行了详细映射和描述,增强了研究的深度和广度。适合致力于发掘基因调控机制,以及蛋白功能解析的科研人员。
P1 Overview of IMP database
该平台提供了高质量的基因组装功能,涵盖84种药用植物,总共约810万个基因。首页提供了友好的全球索引搜索功能,使用户能够快速访问特定基因或基因集合。此平台包含10个分析模块,为研究人员提供有效的数据探索与解释工具,从而加速科研进度。所有模块页面都配有视频教程,方便用户学习如何使用这些工具。
P8 IMP - Gene map viewer module
该视频展示了基因图谱查看器模块如何助力研究者在染色体脚手架上考察基因间是否能形成基因簇,这对于特定代谢途径的认知至关重要。提到了两种模式——注解模式和整体模式,前者提供了全基因组基因分布的宏观视图,后者则聚焦于基因分布模式的详细观察。视频解释了如何通过交互式操作,例如缩放和点击,来深入探索目标基因所在局部染色体区域,并连接到IGV基因浏览器获取更精细的信息。为希望深入了解基因图谱并加强基因分布式学习的研究者提供了实用工具,使之能更直观地理解遗传信息和功能分类。
P13 IMP - GO KEGG enrichment analysis module
功能富集分析是解码生命科学领域高通量数据的关键步骤,它利用基因本体论(GO)和KEGG注释来识别显著的基因集。视频中介绍了如何使用基于费舍尔精确检验和过表达分析(ORA)的KEGG富集分析方法来确定重要基因集。泡泡图展示了与生物过程特别相关的富集基因本体论术语,并通过富集p值、基因数量和奇偶比来对这些术语进行可视化,其中使用了贝尼亚米尼-霍克伯格(Benjamini-Hochberg)程序对多重检验进行校正。此外,用户可以选择显示哪些富集术语,并根据需要自定义颜色主题。这一内容非常适合从事生物信息学、数据分析、遗传研究、生物统计以及生物科学研究的专业人士。
P11 IMP - Sequences fetch module
新的序列获取模块允许研究人员方便地下载相关的序列数据,包括基因的编码顺序(CDS)和蛋白质的促进子序列,用于进一步分析单个或多个基因。这些基因列表通常由全局搜索功能或通过BLAST算法得到,实现数据的高效交互。用户在演示界面操作后,系统会在几秒钟内展示结果下载按钮,从而提供了一个高效且用户友好的结果获取方式。此技术主要适合于需要迅速获取和分析基因序列数据的生物信息学家和分子生物学研究人员。
学习排行榜,夺榜够刺激!奖品够给力!
在这个在线平台上,用户通过坚持每日学习并完成至少15分钟的学习任务,能够触发打卡机制记录他们的学习进度。系统不仅设有周奖励,如VIP卡、付费课程抵扣券等,还升级了月奖励,提供小米手环、定制化键鼠等实物激励。用户可以轻松参与,只需登录平台并进行简单操作即可加入排行榜竞争。学习成果会呈现在排行榜上,以增加用户间的互动性与竞争性。这个机制适合于有志于自我提升且喜欢有形回报的学习者。
前端李游携手短视频,祝51CTO18周年生日快乐!
本视频来自51CTO平台的资深前端讲师,讲述了平台成立18周年的里程碑,以及个人短视频账号的开通。讲师鼓励追求前端学习的听众在新的一年里继续努力,同时邀请他们关注自己的教学内容。视频内容适合对前端技术有浓厚兴趣、希望通过在线教育提升个人技能以及想要构建个人学习网络的人群。