P42 Python pandas使用05

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Python数据分析Python基础绘图pandas基因表达分析矩阵操作数据重命名矩阵转置数据合并数据可视化散点图直方图热图
本视频详细介绍了如何使用Pandas库进行基因表达数据的处理和分析,包括如何对矩阵进行转置、重命名、合并以及删除不必要的数据列。进一步探讨了如何将样品信息与表达数据合并,并利用Pandas进行基本的数据可视化,例如绘制两个基因表达的相关性散点图和直方图,并通过Matplotlib库对图表进行自定义设置。视频还对比了Pandas和Seaborn两种绘图方法的差异,并展示了如何使用Seaborn库轻松绘制热图,以及计算样品之间的相关性。这一系列操作旨在便于生物信息学家对基因表达数据进行更深入的分析。
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陈同 生信宝典
2009 年本科毕业于东北林业大学,2015 年硕博毕业于中国科学院遗传与发育生物学研究所,研究方向涉及高通量数据分析、生物信息工具开发、合成生物学、表观组学等,在Cell Stem Cell (封面文章),Nucleic Acids Research,Nature communications, Protein & Cell, iMeta等高水平杂志以第一或通讯作者发表文章十余篇,累积引用 3000 +次;开发在线绘图和分析平台 ImageGP、BIC、EVenn、植物整合基因组平台IMP (获中华中医药学会 2023 年年度十大学术进展之一),使用超 70 万人次;运营有十四万人关注的微信公众号《生信宝典》,分享有1400 多篇生物信息分析原创文章、教程和视频,阅读播放千万次。联合创办iMeta期刊,现为执行主编,致力于打造微生物和生物信息领域的国产高水平综合性杂志。
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