P57 实战练习(三)05

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Python数据分析Python基础绘图正则表达式字符串匹配python编程序列处理匹配对象列表操作文件读取
本次展示涉及使用正则表达式进行序列模式匹配问题的解决方法。介绍了CCNNGG序列模式匹配的具体实现,如使用点符号代表任意字符。讨论了findall和finditer方法的不同用途,其中findall用于获取所有非重叠匹配字符串,而finditer则返回匹配对象集合。说明了读取文件、处理字符串至列表中的程序设计。同时,文中还提出了对不完整代码的问题诊断及改进方法,代码逻辑分析以及判断字符串开头符号的技巧。内容适合对Python编程和正则表达式有一定基础,并对生物信息学数据处理感兴趣的科学家、程序员、生物信息学者及学生。
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陈同 生信宝典
2009 年本科毕业于东北林业大学,2015 年硕博毕业于中国科学院遗传与发育生物学研究所,研究方向涉及高通量数据分析、生物信息工具开发、合成生物学、表观组学等,在Cell Stem Cell (封面文章),Nucleic Acids Research,Nature communications, Protein & Cell, iMeta等高水平杂志以第一或通讯作者发表文章十余篇,累积引用 3000 +次;开发在线绘图和分析平台 ImageGP、BIC、EVenn、植物整合基因组平台IMP (获中华中医药学会 2023 年年度十大学术进展之一),使用超 70 万人次;运营有十四万人关注的微信公众号《生信宝典》,分享有1400 多篇生物信息分析原创文章、教程和视频,阅读播放千万次。联合创办iMeta期刊,现为执行主编,致力于打造微生物和生物信息领域的国产高水平综合性杂志。
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