P30 生信分析案例03

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编程学习Pythonpython编程文本处理字典操作字符串操作文件读取数据清洗数据统计条件判断循环遍历
本视频为观众演示了如何使用Python编程语言进行基因数据的处理,包括文件读取、字符串分割、条件判断以及字典操作等技术。演示者通过读取文本文件,每一行按照tab键分隔后抽取染色体名和区域类型,并统计特定类型(如基因transport)的区域数量。演示中,演示者提到了两种不同的方法对染色体出现次数进行计数,一种使用get方法,一种使用直观的if-else结构,目的是为了将染色体的名称及其对应的基因数量存入一个字典中,最终通过遍历该字典输出每个染色体上基因的数量。这个视频内容适合具有基本Python知识希望学习文件处理和数据统计的学习者。
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陈同 生信宝典
2009 年本科毕业于东北林业大学,2015 年硕博毕业于中国科学院遗传与发育生物学研究所,研究方向涉及高通量数据分析、生物信息工具开发、合成生物学、表观组学等,在Cell Stem Cell (封面文章),Nucleic Acids Research,Nature communications, Protein & Cell, iMeta等高水平杂志以第一或通讯作者发表文章十余篇,累积引用 3000 +次;开发在线绘图和分析平台 ImageGP、BIC、EVenn、植物整合基因组平台IMP (获中华中医药学会 2023 年年度十大学术进展之一),使用超 70 万人次;运营有十四万人关注的微信公众号《生信宝典》,分享有1400 多篇生物信息分析原创文章、教程和视频,阅读播放千万次。联合创办iMeta期刊,现为执行主编,致力于打造微生物和生物信息领域的国产高水平综合性杂志。
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