13 EMBOSS安装和使用(序列比对、引物设计、电子PCR)02

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Linuxpcr引物设计序列分析awk脚本编程引物匹配序列比对算法
视频提供的内容主要介绍了生物信息学中PCR引物设计的过程,包括如何移除或添加特定序列区域的参数以满足实验要求,以及如何运用AWK脚本进行序列文件的格式化。同时,讲述了使用primer search工具进行电子PCR,模拟引物与模板配对过程及比对分析,并通过middle all算法实现序列的两两比对。此外,还涉及了如何自动生成发射序列的自动化脚本。这些技术点适合于有生物信息学背景、对PCR实验设计和序列分析有兴趣的研究人员,尤其是那些熟悉AWK脚本编程的技术人员。
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陈同 生信宝典
2009 年本科毕业于东北林业大学,2015 年硕博毕业于中国科学院遗传与发育生物学研究所,研究方向涉及高通量数据分析、生物信息工具开发、合成生物学、表观组学等,在Cell Stem Cell (封面文章),Nucleic Acids Research,Nature communications, Protein & Cell, iMeta等高水平杂志以第一或通讯作者发表文章十余篇,累积引用 3000 +次;开发在线绘图和分析平台 ImageGP、BIC、EVenn、植物整合基因组平台IMP (获中华中医药学会 2023 年年度十大学术进展之一),使用超 70 万人次;运营有十四万人关注的微信公众号《生信宝典》,分享有1400 多篇生物信息分析原创文章、教程和视频,阅读播放千万次。联合创办iMeta期刊,现为执行主编,致力于打造微生物和生物信息领域的国产高水平综合性杂志。
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