12 生信实战-文库拆分和16S序列合并01

217未经授权,禁止转载
Linux实战命令行工具文本处理数据注释awk文件合并测序数据索引数据拆分批次效应数据预处理。
本技术分享提供了使用命令行工具对生物信息学数据进行注释和处理的方法。主要技术点包括运用AWK实现基因功能注释的更新,使用命令行技巧合并多个样本的表达数据,以及处理二代测序数据的策略。讲解了如何将多个样本文件合并成矩阵,并提供了通过命令快速添加新的基因描述的技巧。此外,针对测序数据,描述了如何利用索引(index)和barcode技术来区分和处理混合在一起的样本数据,以及如何降低批次效应和成本。内容富含实操性,适合生物信息学者、生物统计分析人员、高级生物数据分析师和基因组学研究者等。
讨论{{interaction.discussNum ? '(' + interaction.discussNum + ')' : ''}}
ad
发布
头像

{{ item.user.nick_name }} {{ EROLE_NAME[item.user.identity] }}

置顶笔记
讨论图
{{ item.create_time }}回复
  • 删除

    是否确认删除?

    确认
    取消
  • {{ item.is_top == 1 ? '取消置顶' : '置顶'}}

    已有置顶的讨论,是否替换已有的置顶?

    确认
    取消
{{ tag.text}}
头像
{{ subitem.user.nick_name }}{{ EROLE_NAME[subitem.user.identity] }}
{{ subitem.create_time }}回复
删除

是否确认删除?

确认
取消
发布
{{pageType === 'video' ? '讨论区抢占沙发,可获得双倍学分' :'讨论区空空如也,你来讲两句~'}}
发布
{{tips.text}}
{{ noteHeaderTitle }} 笔记{{ hasMyNote ? '我的笔记' : '记笔记' }}
{{ hasMyNote ? '我的笔记' : '记笔记' }}
优质笔记
更新于:{{ $dayjs.formate('YYYY-MM-DD HH:mm:ss', item.last_uptime*1000) }}
头像
{{ detail.username }}

公开笔记对他人可见,有机会被管理员评为“优质笔记”

{{ noteEditor.content.length }}/2000

公开笔记
保存
讲师头像
陈同 生信宝典
2009 年本科毕业于东北林业大学,2015 年硕博毕业于中国科学院遗传与发育生物学研究所,研究方向涉及高通量数据分析、生物信息工具开发、合成生物学、表观组学等,在Cell Stem Cell (封面文章),Nucleic Acids Research,Nature communications, Protein & Cell, iMeta等高水平杂志以第一或通讯作者发表文章十余篇,累积引用 3000 +次;开发在线绘图和分析平台 ImageGP、BIC、EVenn、植物整合基因组平台IMP (获中华中医药学会 2023 年年度十大学术进展之一),使用超 70 万人次;运营有十四万人关注的微信公众号《生信宝典》,分享有1400 多篇生物信息分析原创文章、教程和视频,阅读播放千万次。联合创办iMeta期刊,现为执行主编,致力于打造微生物和生物信息领域的国产高水平综合性杂志。
TA的视频
接下来播放:
自动连播