17 实战题目讲解02

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实战fasta格式处理字符串转换序列长度计算awk编程数据标准化文本文件处理三目运算符基因表达数据bed文件分析交集计算
视频教程主要围绕基因序列数据处理技术进行讲解,包括如何使用脚本将FASTA格式的序列中的小写字符转换为大写、计算单条或多条基因序列的长度,并输出特定的文件格式。涉及到了AWK编程技巧,如判断语句、循环处理以及三目运算符的使用,以应对复杂的文本处理场景。此外,视频还介绍了基因表达数据的标准化处理方法和利用BED文件分析工具对基因区域测序深度和交集区域进行分析的技巧。内容丰富,逻辑清晰,适合对基因数据分析、基因组学和生物信息学有一定了解和兴趣的科研人员、生物信息分析师以及学生等观看。
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陈同 生信宝典
2009 年本科毕业于东北林业大学,2015 年硕博毕业于中国科学院遗传与发育生物学研究所,研究方向涉及高通量数据分析、生物信息工具开发、合成生物学、表观组学等,在Cell Stem Cell (封面文章),Nucleic Acids Research,Nature communications, Protein & Cell, iMeta等高水平杂志以第一或通讯作者发表文章十余篇,累积引用 3000 +次;开发在线绘图和分析平台 ImageGP、BIC、EVenn、植物整合基因组平台IMP (获中华中医药学会 2023 年年度十大学术进展之一),使用超 70 万人次;运营有十四万人关注的微信公众号《生信宝典》,分享有1400 多篇生物信息分析原创文章、教程和视频,阅读播放千万次。联合创办iMeta期刊,现为执行主编,致力于打造微生物和生物信息领域的国产高水平综合性杂志。
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